RFD4-Proteina використовує пошук із винагородою для проєктування білків

У блозі NVIDIA описала RFD4-Proteina — відкриту модель BioNeMo, розроблену спільно з Інститутом дизайну білків Медичної школи Вашингтонського університету. У матеріалі показано, як за її допомогою створювати кандидатів у білки-зв’язувачі для онкологічної мішені PD-L1.

Модель одночасно проєктує послідовності та повноатомні структури білків, а пошук із винагородою під час генерації спрямовує обчислення на перспективні варіанти. Це дає змогу оцінювати кандидатів за заданими критеріями до їхньої експериментальної перевірки.